基于转录组学和蛋白质组学的热带雨林肺动脉高压大鼠模型的新靶点

冠状动脉真空（PH）是指周期病态地时不等冠状动脉压≥25 mmHg。 它根据血块物理病态质特病态、得病必要和病变学分别为五类。 第三类高纬度冠状动脉真空（HAPH）是由于在高纬度诱发环境里面肺摇动用量代偿病态增加和肺小动脉外周造成了的，加剧高原心肌病。 临床病因包括运动病态呼吸困难、腹痛和疲劳。 HAPH 显然说明了了未能适不宜高纬度，并伴有不正确的病变生理必要。 大约有 1.4 亿人生活在高山 2,500 米以上的海地区，每年有超过 4,000 上千人会面这些高纬度海地区。 诱发加剧肝脏病态状表达谱发生关联变既有； 这值得注意长年居住在高纬度海地区的周边海地区及其先祖的表现型灵活病态变既有里面知道的。HAPH 的放射治疗仍在研究课题里面。不宜建言高血压移至高于高山海地区，氧疗精确病态。类固醇放射治疗的研究课题仅限于一些随机次测试。 HAPH 的病变与其他类型的 PH 近似于，因此值得考虑对 PAH 精确病态的类固醇是否对 HAPH 精确病态。

然而，所有这些小分子结构类固醇都在HAPH里面的精确病态病态和必要尚不正确。为明白决这个问题，我们主旨研究课题诱发所涉及的分子结构必要，用作家兔 HAPH 数学方法，并不宜用示范除此以外成员学方法。 在此全过程里面，我们主旨研究课题几种小分子结构类固醇和复氧的作用，以未确定高纬度造成了的诱发的潜在新放射治疗靶点。 特别是，我们研究课题了小分子结构类固醇如何不良影响肝脏之间的关联病态状和氨基酸表达。

研究课题设计：

将家兔放在 10% O2（诱发）寝室里面 3 周以诱发 PH。解读家兔（C 组成员）在整个实验里面都处于常氧环境下，并在放射治疗前夕（即从第 21 天开始）用媒介展开放射治疗。 3由此可知，其余家兔随机分别为六组成员；一组成员被处死（第 21 天）以评估心肺新功能。其余 5 组成员用小分子结构类固醇或复氧放射治疗，从第 21 天到第 35 天处死。慢病态诱发，媒介检视（M）；慢病态诱发，司来帕格放射治疗；慢病态诱发，马西替坦放射治疗；慢病态诱发，riociguat 放射治疗；慢病态诱发、复氧 (RE)。

核糖体组成员数据分析：

分离出总 RNA，并通过用作 Arraystar rRNA Removal Kit 添加 rRNA 来硫既有物 mRNA 和非区块 RNA。 mRNA 和非区块 RNA 被片段既有酿酒酵母分解成记录片段（~200-500 nt）。以记录片段为巨集，为了让随机六聚体亚硫酸盐制备第一核酸cDNA。在第二核酸制备全过程里面，dTTP 被 dUTP 摒弃。 然后转至洗脱酿酒酵母以通过末端翻修和添加腺嘌呤来纯既有和除去记录片段。 记录片段被纯既有并与螺栓连接起来； 用作嘧啶-N-糖基既有酶消既有第二条核酸。 琼脂糖胶体后，选项适宜的片段作为巨集展开PCR增为。 用作 Agilent 2100 生命体数据扫描仪和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 管理系统对混合物库展开定用量和高于质用量评估。 该文库用作 Illumina HiSeq 2000 管理系统展开测序。

LC-MS/MS 数据分析

在连接起来到 Easy-nLC 1000 液相液相管理系统的Q Exactive HF 质谱仪上数据分析混合物。将炎热的肽混合物再硫酸在有机溶剂 A（0.1% 甲酸水溶液）里面并查找到逮集柱里面用作有机溶剂 A 的最大压力为 280 bar，然后在自行设计的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的梯度展开除去流动相 B（乙腈和 0.1% 甲酸），水流为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 数据分析是在 3e6 离子的自动增益控制目标下展开一次以外扫描，然后展开多达 30 次与数据关的的 MS/MS 扫描较强更高能用量的碰撞解离，在 Orbitrap 里面检测到（R = 15,000 在 200 m/z）。

研究课题结果：

基于RNA-seq数据的共表达在线的新功能硫既有物数据分析和航空港分子结构鉴别。

基于氨基酸数据的共表达在线的新功能硫既有物数据分析和航空港分子结构鉴别。

RNA-seq 和氨基酸组成员学揭示了对三种类固醇的加成之间的最弱关的病态，较强仍然相同的功效。GO 硫既有物说明了关联表达的病态状包括进行葡萄糖调节、核糖体和翻译的病态状。

司来帕格、马西替坦和复氧可改善 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被鉴别出来，通过除此以外成员学选取，作为进行HAPH的这两项病态状。这些断定为 HAPH 的小分子结构类固醇必要备有了属于自己观点。

研究课题结论：

Selexipag、macitentan 和复氧显着减慢了家兔 HAPH 数学方法，而 riociguat 的作用极强。 关联表达的病态状进行葡萄糖调控、核糖体和翻译。 某些氨基酸受到 HAPH 和放射治疗的不良影响。 我们用作除此以外成员学方法选取了这两项病态状 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些断定显然适度很好地明白诱发所涉及的分子结构必要，并显然备有属于自己放射治疗靶点。

文献原文：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.